《黑太阳731》是一部揭露日本731部队黑暗历史的电影。影片背景设定在第二次世界大战前夕,讲述了日本在中国东北扶植满洲国,并于哈尔滨设立从事细菌武器研究的731部队研究本部。1945年2月,日军军医中将石井四郎返回并执掌731部队,与他一同到来的还有一班出自千叶县的少年队员。这些少年组成的“少年班”被军方寄予厚望,他们和研发中的新式细菌武器被视为挽救日本败局的希望所在。然而,在严苛的训练中,少年们被迫参与了惨无人道的实验,包括用中国人、朝鲜人和白俄做试验的冻伤实验、细菌炸弹实验以及活体解剖实验。这些血腥的场面扭曲了少年们的天性。随着1945年初夏的到来,日本军国主义的失败已经不可避免,石井四郎疯狂地试图通过制作鼠疫炸弹来拯救“大日本帝国”,但最终未能改变法西斯覆灭的命运。