该剧讲述了红色特工在抗战时期为保护党的秘密而展开的一系列惊心动魄的故事。故事从延安杨家岭的一个平静早晨拉开序幕,远在上海的阴雨天气下,一场针对地下党的巨大阴谋逐渐浮出水面。站长卢戡发现内鬼刘仲达的真实身份,并亲眼目睹其对报务员韩筱的背叛行径。在生死关头,卢戡拼死护送重要情报人员曹姓男子逃离虎口,途中意外结识了神秘而忠诚的护卫钉子。然而,随着形势恶化,总部遭遇袭击,电台被炸,延安方面不得不启用代号“零号特工”的紧急预案:小学教师李文鼎的身份将被取代,由新上任的红色特工曹烈云接替任务,一场关乎生死存亡的秘密行动就此展开。