为了应对新型基础设施建设及恐怖袭击的威胁,湾岸署迁入配备高级安保系统的新大楼,由刑事课强行犯系系长青岛俊作(織田裕二饰)负责主持搬迁工作。尽管事前已有周密部署,但搬迁过程中依然混乱不堪。在此期间,湾岸署辖区内接连发生多起奇怪的抢劫案,更为棘手的是,青岛、恩田堇(深津絵里饰)及王明才(滝藤賢一饰)的配枪在搬迁过程中被盗。不久后,有人利用这些配枪实施无差别杀人,令湾岸署陷入前所未有的危机。随后,恐怖分子控制了新湾岸署的安保系统,并要求释放包括日向真奈美(小泉今日子饰)在内的多名重刑犯。在恐怖分子的威胁下,青岛俊作必须面对这场史无前例的挑战,既要解救人质,又要挫败恐怖分子的阴谋。本片是同名电视剧的第三部剧场版,展现了警方在高科技安保环境下与恐怖主义的激烈对抗。