五岁的宗介生活在海边小城,家位于临海悬崖上。一天,他在海边发现了一个被冲上岸的废玻璃瓶,里面困着一条小金鱼——波妞。波妞是人鱼女王的女儿,偷偷驾着水母出游时撞进瓶中。宗介将波妞带回家,养在塑料盆里。两人相处愉快,波妞对宗介产生了深厚的感情,宗介也对这个小金鱼充满喜爱。 然而,快乐的时光很快结束。波妞的父亲藤本将她带回了海底世界。波妞思念宗介,决定变成人类与他团聚。在妹妹的帮助下,她偷取了父亲的法宝——生命之水,开始向人类世界游去。然而,生命之水在她手中失控,引发了巨大的灾难:海水暴涨,暴风肆虐,妹妹们变成了可怕的巨型鱼,海浪直扑宗介一家所在的悬崖。 海边小城被淹没,波妞意识到自己鲁莽的行为导致了灾难。她能否在这一切中挽救宗介呢?