侵华战争时期,日本人将掠夺的北京猿人头骨偷运回国,途中因沉没成为一桩悬而未决的疑案。数十年后,在和平环境下,日本科学家重新研究这些头骨化石,成功提取出其中的DNA残片并进行基因培育。他们将培育出的北京猿人胚胎送入太空,希望通过太空中的粒子辐射使其发育成熟。然而,搭载着猿人胚胎的飞船发生事故,坠落在一个海岛。幸运的是,北京猿人成功诞生。在这部电影中,王祖贤饰演的中国女间谍被赋予秘密任务,试图将北京猿人偷运回国。与此同时,日本科学家也展开了各种手段与她周旋。经过一番明争暗斗,双方最终达成共识:北京猿人并非任何国家的财富,而是属于大自然。于是,猿人一家三口与一只通过基因技术复制出来的猛犸象被放归自然,结束了这场跨国的争夺与研究。